Localizada na Alameda Nothmann, região central de São Paulo, a Funarte SP nasceu em 1977, quando um escritório foi instalado em uma das salas do casarão histórico que, então, abrigava a Delegacia Regional do Ministério da Educação e Cultura. Em 28 de março do ano seguinte, o Teatro MEC – Funarte foi inaugurado com o espetáculo Rezas de Sol para a missa do vaqueiro, de Janduhi Finizola, com direção de Renato Borghi.

A partir da década de 1980, a Funarte SP incorporou novas salas de espetáculos e galerias, chegando ao Complexo Cultural que existe hoje. Grande parte dessa trajetória é devida à Lulu Librandi, primeira coordenadora da Funarte SP, que integrou sua gestão na regional a experiências históricas como o Projeto Pixinguinha e as vanguardas paulistanas.  Nos anos 1980, o Complexo Cultural Funarte SP impulsionou a carreira de artistas de vanguarda, como Itamar Assumpção, Arrigo Barnabé, Guto Lacaz, Miécio Caffé e Myriam Muniz.

Já nos anos 1990 e 2000, consolidou-se como espaço aberto para a experimentação de linguagens, o desenvolvimento profissional de artistas e trabalhadores da cultura, a mediação e a formação de público. Os principais instrumentos utilizados para ocupação dos espaços são os Editais e Chamadas Públicas. Atualmente, o Complexo Cultural Funarte SP é composto por três edificações: Galpões Lulu Librandi, Galpões anexos, Casarão histórico.